请问在加拿大滑铁卢大学留学的时候挂科一门能申研吗？

可以的，硕士考核是综合来评选的，有一门挂科对于申请肯定会有影响，但是并不是完全堵死了申请硕士的这条路，根据综合成绩，是可以申请到对应符合条件的大学的。