专业课有低分对美研申请有多大影响?

影响是肯定的，你自己也算出来GPA往下掉了一分多。
只是还要看这是两门什么样的课程，你的排名情况，这门课程如果总体打分不高，可以作附加说明。
以及，有人直接就把这两门课程删掉了，一了百了。